FK 조나바 B(리투아니아어: FK Jonava B)는 리투아니아의 도시 요나바를 연고로 하는 축구 클럽이다. 현재는 리투아니아 3부 리그인 아테이티스 리가에 속해 있다.
이 팀은 FK 조나바의 예비팀으로 1995년에 설립되었다. 2014년에 처음으로 아테이티스 리가에 진출했고, 2017년에 리그에서 우승했다.
그 후 2018년 리투아니아 2부 리그인 피르마 리가에 진출했지만, 2020년에 다시 아테이티스 리가로 강등되었다.
클럽은 2022 리투아니아 컵에서 준우승을 차지했다.
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