메르스타 IK는 1912년 10월 3일에 창설되었다. 클럽은 처음에는 "메르스타 BK"라는 이름으로 알려졌지만 1916년에 이름을 "메르스타 IK"로 변경했다. 클럽은 처음에는 지역 리그에서 경쟁했지만 1940년대에 더 높은 리그로 승격하기 시작했다.
메르스타 IK는 1950년대에 알스벤스칸(스웨덴의 최상위 리그)에 도달했지만 몇 시즌 만에 강등되었다. 클럽은 1960년대와 1970년대에 알스벤스칸과 디비전 1(2부 리그) 사이를 오가며 경쟁했다.
1980년대에 메르스타 IK는 재정적 어려움을 겪기 시작했고 1982년에 파산 신청을 냈다. 클럽은 1983년에 재건되었지만 더 이상 이전의 수준으로 돌아가지 못했다.
메르스타 IK는 현재 스웨덴의 4부 리그인 디비전 2 노라 슈베리에에서 경쟁하고 있다. 클럽은 2017년에 디비전 2에 승격했고 그 이후로 이 리그에서 경쟁하고 있다.
메르스타 IK의 홈 구장은 메르스타 IP이다. 메르스타 IP는 1912년에 개장했으며 4,000명을 수용할 수 있다.
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